Rabbi Yehouda ben Attar naquit à Fès, au Maroc, au mois d'Eloul 5415 (1655). Son nom, « Attar », signifie « parfumeur » en arabe, d'après le métier de ses ancêtres. Son père, Rabbi Yaakov, mourut à vingt-trois ans ; le jeune Yehouda dut travailler pour vivre et devint un orfèvre accompli. Toute sa vie, même devenu rabbin, il vécut du travail de ses mains, refusant tout salaire de la caisse publique. Les Juifs marocains l'appellent « Rabbi Yehouda Hakadoch ».

Élève de Rabbi Vidal Hatsarfati III et de Rabbi Mena'hem Serero, il fut nommé dayan à Fès à leurs côtés en 1698, à quarante-trois ans. En 1701, il dut partir pour Meknès avec de nombreux Juifs de Fès, persécutés et écrasés d'impôts par le sultan Moulay Ismaïl ; il y siégea au tribunal rabbinique, puis en fut l'unique dayan à partir de 1713. Revenu à Fès, il prit la tête de la communauté et présida le tribunal rabbinique pendant de longues années.

Il est l'auteur de Min'hat Yehouda, ainsi que de décisions et d'ordonnances (takanot), signées avec les grands sages de sa génération, qui guidèrent la vie communautaire marocaine. La tradition rapporte de nombreux miracles à son sujet, notamment qu'il fut jeté dans une fosse aux lions sur l'ordre du sultan et en ressortit indemne.

Il quitta ce monde le 19 Sivan 5493 (1733) et repose au cimetière juif de Fès, où sa tombe reste un lieu de pèlerinage.