Rabbi Chim'on Sofer naquit à Presbourg le 13 Tevet 5581 (18 décembre 1820). Il était le fils du 'Hatam Sofer, Rabbi Moché Sofer, rabbin de la ville, et de Sarah, fille de Rabbi Akiva Eiger. À dix-sept ans, il épousa Myriam, fille de Dov Ber Sternberg de Carei (Nagykároly), puis revint s'installer à Presbourg auprès de son père.

Il étudia la Torah auprès de son père, qui l'appelait affectueusement « Chim'on 'Hassida ». Après la mort du 'Hatam Sofer, il participa avec son frère aîné, Rabbi Avraham Chmouel Binyamin, à l'édition des écrits de leur père, notamment du premier volume des responsa 'Hatam Sofer sur Yoré Dé'a.

Vers 5604 (1844), il devint rabbin de Mattersdorf, poste que son père avait occupé autrefois. Par humilité, il refusa plusieurs autres rabbinats, dont celui de Nikolsburg. En 5621 (1861), il accepta celui de Cracovie, qu'il occupa vingt-deux ans. Chef de file du judaïsme orthodoxe de Galicie, il fonda l'association Ma'hzikei Hadat et son hebdomadaire du même nom, et fut élu en 1879 au Reichsrat, le parlement autrichien. L'empereur François-Joseph le décora pour les soins qu'il avait fait donner aux blessés de la guerre de 1866.

Attaché de tout son cœur à Erets Israël, il participa à Cracovie à la fondation de l'association Roch Pina. Ses œuvres, discours et responsa, portent le titre Mikhtav Sofer.

Il quitta ce monde à Cracovie le 17 Adar II 5643 (26 mars 1883). Ses dernières paroles, adressées à son gendre Rabbi Akiva Kornitzer, qui lui succéda, évoquaient son désir de toujours de monter en Terre sainte. Il repose au nouveau cimetière juif de Cracovie.