Rabbi Raphaël Pinto était le fils de Rabbi 'Haïm Pinto de Casablanca, dit 'Haïm Pinto Hakatan (5625-5698, 1855-1937), lui-même petit-fils de Rabbi 'Haïm Pinto Hagadol de Mogador.

Homme d'une grande piété, entièrement attaché au service de Dieu et à l'accomplissement des mitsvot, il a rapproché beaucoup de gens. Juifs comme Arabes venaient à lui pour chercher réconfort et bénédiction. Ceux qui venaient prier ou allumer des bougies, accablés par les épreuves, étaient accueillis chaleureusement ; il leur offrait habituellement un verre de mahia et leur racontait des histoires de tsaddikim et des miracles qu'ils avaient accomplis.

Il enseignait aux pèlerins qu'il était interdit de montrer sa tristesse dans la maison de Rabbi 'Haïm Pinto, car la foi grandit dans la joie. Sa maison, modeste d'apparence, était réputée pour l'enseignement qui en sortait, et la qualité que l'on y remarquait avant tout était l'humilité.

Selon Hevrat Pinto, peu avant sa mort, Rabbi 'Haïm Pinto réunit ses fils pour les bénir et se mit à pleurer en arrivant à Rabbi Raphaël, annonçant qu'il connaîtrait une fin terrible. En 1980, des malfaiteurs s'introduisirent de nuit dans sa maison, le frappèrent violemment avec une barre de fer et le dépouillèrent ; après une semaine de grandes souffrances, Rabbi Raphaël rendit son âme à Dieu.